I. erreur liée à l'équipement de synthétiseur de gènes de 48 voies:
1. Erreur du système d'échantillonnage
Fluctuation de la précision du pipetage:
Il peut y avoir des différences dans les pompes ou les vannes de pipetage des différents canaux, ce qui entraîne des incohérences dans la quantité de remplissage (par exemple, distribution inégale de monomères de base).
Après une utilisation prolongée, les pièces de pipetage s'usent ou se bloquent, provoquant des écarts de volume.
Contamination croisée:
Une étanchéité insuffisante entre les canaux conduit à la diffusion de résidus liquides ou de volatils, provoquant une contamination des bases ou des enzymes.
2. Erreur de contrôle de température
Différence de température du système réactionnel:
L'uniformité de la température du module de chauffage à 48 canaux est insuffisante, la température de certains emplacements de pores est élevée ou faible, ce qui affecte l'efficacité de l'extension.
Les taux de réchauffement / refroidissement ne sont pas cohérents, ce qui entraîne une réaction de PCR ou de connexion non synchronisée.
Pression inégale du couvercle thermique:
Le couvercle chaud n'est pas en contact étroit avec la plaque de réaction, une partie de l'évaporation des pores est grave, ce qui modifie le volume du système réactionnel.
3. Erreur de système de détection
Déviation de détection de fluorescence / Absorbance:
Les différences de sensibilité des détecteurs optiques dans les différents canaux conduisent à un mauvais jugement de l'efficacité de la synthèse.
Interférences de bruit de fond (par exemple, extinction par fluorescence ou diffusion) qui affectent la précision de la surveillance en temps réel.
4. Défaillance mécanique
Séparation inégale des billes magnétiques ou mélange oscillant:
Module magnétique différence d'intensité du champ magnétique, entraînant une efficacité différente de récupération des billes magnétiques, affectant l'effet de lavage ou de purification.
La fréquence ou le temps d'oscillation n'est pas cohérent, ce qui entraîne un mélange réactionnel inadéquat.
Erreur de fonctionnement et de processus du synthétiseur de gènes 48 voies:
1. Mauvaise configuration du programme
Paramètre entrée biais:
Le cycle de synthèse (p. ex., le temps d'élongation, la température de dénaturation) est mal réglé, ce qui entraîne une augmentation de la longueur du fragment ou du taux de mésappariement.
Les paramètres ne sont pas ajustés en fonction du type de modèle (par exemple, contenu élevé en GC, Structure secondaire).
Vulnérabilités des scripts automatisés:
Les procédures en plusieurs étapes (p. ex. coupure, assemblage, Purification) sont mal articulées, ce qui entraîne une interruption de la réaction ou une manipulation excessive.
2. Problèmes de chargement des échantillons
Erreur d'ordre ou de position d'addition:
La contamination par l'ADN exogène a été introduite lorsque l'échantillon artificiel n'a pas été effectué conformément aux spécifications (p. ex. sans remplacement de la tête du pistolet).
Les différences dans la quantité de matière de départ entre les canaux (p. ex., concentration différente en amorces) entraînent une efficacité de synthèse inégale.
3. Faible efficacité de purification et de récupération
Perte de purification de billes magnétiques ou de film de gel de silice:
La perte d'adsorption de petits fragments d'ADN (tels que des oligonucléotides courts) au cours de la purification réduit le rendement.
Le lavage est imparfait *, les sels résiduels ou les impuretés inhibent les réactions ultérieures.
