Les hybrideurs moléculaires sont des dispositifs de base utilisés dans la recherche en biologie moléculaire pour la détection d'acides nucléiques (ADN / ARN) ou de protéines, largement utilisés dans l'analyse de l'expression génique, la détection de mutations et d'autres domaines. Son fonctionnement nécessite le strict respect de processus standardisés pour assurer la précision expérimentale. Voici le processus d'utilisation complet et les points clés:
I. préparation avant l'expérimentation
1. Préparation des échantillons et des sondes
- extraction des acides nucléiques cibles (par ex. ADN génomique, ARNm) à des fins expérimentales, transfert sur un support en phase solide (membrane Nylon / Membrane PVDF) après découpage enzymatique, séparation électrophorétique.
- marquage de sondes: marquage de sondes oligonucléotidiques spécifiques par isotope (³²p), colorant Fluorescent ou biotine, vérification de la pureté et de la concentration de la sonde.
2. Inspection des instruments
- Confirmez que le système de contrôle de la température de l'hybridome est normal, que la fonction du Shaker est stable et que la colle d'étanchéité n'est pas cassée par le vieillissement.
- préchauffer l'instrument à la température de consigne (généralement 42 - 65 ° C selon le type de sonde) à l'avance, réduisant l'impact des fluctuations de température sur l'efficacité de l'hybridation.
3. Configuration des réactifs
- formulez le liquide de pré - Hybridation (contenant des agents bloquants tels que l'ADN de sperme de saumon, SDS, etc.), le liquide d'hybridation et le liquide de lavage à concentration de sel gradient, en prenant soin de filtrer et d'éliminer les bactéries pour éviter la contamination.
II. Principales étapes opérationnelles
1. Pré - hybridation
- placer la membrane fixant l'acide nucléique à tester dans le tube d'hybridation, ajouter une quantité suffisante de liquide de pré - hybridation pour immerger la membrane et incuber pendant 1 - 2 heures à la température réglée. Cette étape vise à fermer les sites de liaison non spécifiques sur la membrane, réduisant ainsi le bruit de fond.
- * contrôle critique *: maintenir une légère Oscillation favorise la circulation du liquide et évite la création de bulles.
2. Réaction d'hybridation
- jeter le liquide de pré - hybridation, ajouter directement le liquide d'hybridation contenant la sonde marquée (la concentration finale de la sonde est généralement de 1 à 10 ng / ML) et poursuivre l'incubation sous agitation douce pendant une nuit (8 à 16 heures).
- * stratégie d'optimisation *: température d'hybridation = valeur de TM - 5°C (TM étant la température de démêlage de la sonde), combinant spécificité et sensibilité.
3. Classement du film de lavage
- lavage segmenté à l'aide d'un liquide de lavage à concentration de sel décroissante séquentielle (par exemple, en utilisant successivement 2 × SSC → 0,5 × SSC → 0,1 × SSC) pour éliminer progressivement les sondes non liées ou mal appariées.
- * astuces opérationnelles *: aspirer le liquide résiduel avant chaque changement, un lavage de haute rigueur améliore la spécificité, mais un lavage excessif peut entraîner une perte de signal vrai.
Iii. Détection des signaux et analyse des données
1. Acquisition d'images
- choix du mode de détection correspondant en fonction du type de marqueur de la sonde: radiographie radioactive à pression requise; La méthode de chimiluminescence utilise un imageur CCD; La sonde fluorescente peut être scannée directement.
- * contrôle d'exposition *: Ajustez le temps d'exposition pour éviter la saturation, le réglage synchrone du témoin blanc exclut les interférences de fond.
2 Interprétation des résultats
- analyse quantitative utilisant le logiciel imagej pour calculer les valeurs de gris de la bande, évaluation semi - quantitative du niveau d'expression des gènes; L'analyse qualitative met l'accent sur la cohérence de la position de la bande avec le poids moléculaire attendu.
- * traitement anormal *: en cas de bandes non spécifiques, il est nécessaire de ré - optimiser la conception de la sonde ou d'améliorer la rigueur du lavage.
Iv. Suivi et entretien
1. Élimination des déchets
- les déchets liquides contenant des isotopes sont traités conformément aux spécifications relatives aux déchets radioactifs et les réactifs fluorescents / chimiluminescents sont recyclés dans des conteneurs spéciaux.
2. Entretien des instruments
- vidange du liquide à l'intérieur du tube hybride, désinfection par immersion dans de l'éthanol à 70% après rinçage à l'eau propre, étalonnage régulier du capteur de température.
- l'enregistrement des paramètres de cette expérience (température, vitesse de rotation, temps) est déposé dans le journal de bord de l'appareil pour référence dans les expériences ultérieures.
Le fonctionnement de l'hybrideur moléculaire nécessite un contrôle précis de la température, du temps et de l'environnement de la solution, et tout écart de liaison peut entraîner des résultats faux positifs / faux négatifs. Il est recommandé aux utilisateurs débutants d'effectuer des expériences contrôlées en parallèle et de déterminer les meilleures conditions d'hybridation par pré - expérimentation. L'opération normalisée avec des mesures strictes de contrôle de la qualité peut garantir la fiabilité des résultats expérimentaux.