Système de tri d'enveloppe d'émulsion de fragments d'ADN

Xdrop est un instrument polyvalent et convivial pour la préparation de cellules vivantes de mammifères ou de micro - organismes, d'organites cellulaires, d'ADN ou d'autres Biomatériaux pour des analyses en aval à haute résolution.

Utilisez notreKit xdrop, xdrop encapsule rapidement et en toute sécurité des cellules vivantes, des organites ou des fragments d'ADN, ainsi que des produits chimiques de dosage, dans des gouttelettes bi - émulsionnées de volume picolitre hautement stables. Ces gouttelettes sont stables par pipetage, vortex, incubation, cytométrie en flux, tri et même stockage à long terme. Plus important encore, les cellules peuvent être récupérées à partir des gouttelettes pour l'amplification.

Avec les techniques analytiques appropriées,Les applications xdrop comprennent:

• Cellules immunitaires humaines,Cellules NK

• Sécrétion enzymatique de cellules microbiennes

• Sécrétion de Cytokines par les cellules de mammifères

• Vérification de l'édition de gènes, y compris l'évaluation des réarrangements accidentels sur cible et hors cible

Avec l'aideXdrop， Les chercheurs peuvent ainsi mieux comprendre la fonction cellulaire et la génomique des humains, des animaux, des plantes et des micro - organismes. Xdrop peut également générer des gouttelettes d'émulsion unique pour d'autres flux de travail, y compris l'encapsulation de l'ADN pour une amplification du génome entier sans biais. Nous fournissons une gamme complète de réactifs, kits et accessoires nécessaires pour xdrop. De plus, la formation des utilisateurs fait partie de notre service d'installation standard xdrop.

avantage

• Xdrop peut envelopper des cellules vivantes de mammifères ou de microorganismes dans des gouttelettes bi - émulsion hautement stables pour la détermination fonctionnelle, l'incubation, l'analyse phénotypique et le criblage.

• Xdrop aide à répondre aux questions clés de la recherche sur les cellules conçues et la thérapie génique.

• Xdrop prend en charge les Workflows d'Ingénierie moléculaire, y compris l'évolution enzymatique et l'ingénierie des voies.

• Doté d'une interface conviviale et d'un encombrement réduit, xdrop permet à chaque laboratoire de biologie moléculaire d'utiliser les fonctions * de la microfluidique.

Kit émulsifiant double couche

Tous les réactifs sont inclus dans le kit et peuvent encapsuler des millions de cellules ou de molécules par opération.

Exemples d'applications:

1,Amplification précise du génome entier

En fait,99% du génome cible est couvert plus d'une fois par des lectures séquentielles de la bibliothèque.

utiliserXdrop ™ La technologie DMDA amplifie les gènes pour une amplification fidèle et précise de tous les gènes, même avec des quantités d'entrée aussi faibles que 1 pg.

2, phase génétiquePhasé

L'allèle Cyp2d6 * 7 contient 1 Polymorphisme nucléotidique unique（SNP）， Alors que le Cyp2d6 * 25a contient 22 SNP.

La technologie xdrop est capable de mesurer avec précision les 23 variantes, y compris Phasing (voirbasFigure).

Xdrop ™ Les applications sont soutenues par une conception simple et la capture indirecte de séquences de longs fragments d'ADN (~ 100 KB). Combiné avec le long séquençage à lecture longue, Xdrop ™ La difficulté de phasage génétique dans un seul échantillon hétérogène génétique est surmontée.

La haute fidélité enrichie permet de détecter un ou plusieurs allèlesSNP， Et permet l'assemblage à partir de zéro pour résoudre les changements structurels.

3 - Surveiller les changements structurels génétiquement complexes

Une analyse détaillée des lectures à travers les points d'arrêt montre que, dansPlusieurs sites d'intégration hpv18 sont présents dans les régions du Chromosome 8. Les ensembles de données pacbio, Oxford nanopore et illumina prennent en charge les sites d'intégration identifiés.

Xdrop ® La technologie est une nouvelle méthode d'enrichissement ciblé de l'ADN qui est souhaitable dans la possibilité de sélectionner, d'enrichir et de séquencer des fragments d'ADN naturels. Cela permet d'enrichir une grande partie du génome (environ 100 KB), y compris des régions inconnues. Avec xdrop ® Les longs fragments générés par la méthode ne sont pas seulement adaptés au séquençage en lecture longue, mais peuvent également fournir des informations contextuelles précieuses pour le séquençage en lecture courte.

4, zone d'intérêt inconnue (Séquençage du roi)

La PCR et les méthodes d'enrichissement d'ADN ciblées par sonde nécessitent une optimisation intensive de la conception etZone d'intérêt complète (Roi) connaissance. Ces méthodes traditionnelles sont complexes dans la caractérisationEnvironnement génomique (p. ex., régions répétées, variations structurelles, enrichissementLes districts du GCDomain) et les aspects régionaux inconnus et réarrangés échouent également. Pour surmonter ces limites,Samplix développe une nouvelle approche microfluidique basée sur la capture indirecte de séquencesObtenuXdrop ® Enrichir le workflow.

Xdrop ® Peut enrichir la longueur des paires d'amorces individuelles qui doivent être conçues sur la séquence de détection（~ 100 KB) région de l'ADN cible, correspondant à une petite partie ou région flanquée du roi. Cet amplicon est spécialisé dans la détection, la sélection et l'enrichissement de roi pleine longueur, pour finalement être capturé et séquencé.

utiliserXdrop ® La capacité de la technologie à résoudre ces zones difficiles ouvre la porte à la résolution de nombreuses autres zones difficiles qui peuvent représenter un pourcentage important de la baseÀ cause du Groupe. SeraXdrop ® L'enrichissement, combiné à des techniques de séquençage à lecture longue et courte, peut fournir la haute résolution requise pour résoudre des scénarios génomiques complexes de manière rapide et économique, en contournant le séquençage du génome entier.

5, identification et confirmationOpérations d'édition de gènes crispr

Par un design simple et longCapture indirecte de séquences de fragments d'ADN, xdrop aide à identifier des sites d'insertion transgénique souvent difficiles à trouver et coûteux.

L'intégration aléatoire dans les constructions et la présence de séquences génomiques hôtes compliquent l'identification des sites d'intégration.Xdrop rend la validation de l'ingénierie génomique simple et claire.