Norme de livraison de service de test personnalisé de puce d'ARN d'anneau

Services d'inspection personnalisés pour les puces d'ARN cycliques

Introduction aux techniques expérimentales: ARN cyclique(ircrna) est une nouvelle classe d'ARN qui se distingue de l'ARN linéaire traditionnel, avec une structure cyclique fermée, qui est abondamment présente dans le Transcriptome eucaryote. La plupart des ARN cycliques sont constitués de séquences exoniques qui sont conservées chez différentes espèces, en présence de tissus et de spécificités d'expression à différents stades de développement. En raison deARN cycliqueInsensible aux nucléases, il est donc plus stable que l'ARN linéaire, ce qui donne à l'ARN cyclique un avantage évident dans les applications de développement en tant que nouveau marqueur de diagnostic. Des études récentes ont montré que les ARN cycliques agissent comme des éponges de miarn chez différentes espèces, appelées ARN endogènes compétitifs (CERNA), qui se lient de manière compétitive aux miarn. L'interaction avec les miarn associés à la maladie montre que les ARN cycliques jouent un rôle très important dans la régulation de la maladie.

Processus opérationnel expérimental:

1, prélèvement d'ARN d'échantillon

2, test de qualité d'ARN

① les valeurs d'absorption de l'ARN aux spectrophotomètres 260 nm, 280 nm et 230 nm ont été déterminées à l'aide de NanoDrop pour calculer la concentration et évaluer la pureté.

② l'électrophorèse sur gel d'agarose dénaturé avec des réactifs d'électrophorèse au formaldéhyde pour détecter la pureté et l'intégrité de l'ARN.

③ fournit un rapport de qc d'ARN.

Traitement RNase r

4, synthèse et marquage d'échantillons d'adnc / Arna

5, test de qualité d'efficacité de marquage utilisant NanoDrop pour détecter l'efficacité de marquage fluorescent, l'efficacité de marquage est qualifiée pour garantir la fiabilité des résultats expérimentaux de puce ultérieurs.

6, hybridation de puce

Les sondes bien marquées et les puces génomiques à haute densité sont hybridées dans des conditions standard.

7, acquisition d'images et analyse de données

Scannez l'intensité de fluorescence de la puce à l'aide du scanner genepix 4000b Core - month et convertissez les résultats expérimentaux en une sauvegarde numérique des données, en utilisant le logiciel compagnon pour effectuer des opérations d'analyse sur les données brutes.

8, fournir le rapport expérimental

① Scanning Image: image de balayage de fluorescence Cy3;

② scatter plot: diagramme de dispersion avec l'axe X pour la valeur du signal control et l'axe Y pour la valeur du signal experiment, représentant la tendance de la distribution globale des données du signal;

③ Raw Data: données brutes d'intensité du signal de fluorescence de balayage de la sonde;

④ normalized data: valeur normalisée par des méthodes statistiques;

⑤ P - value: t - test analyse statistique des gènes exprimés de manière significativement différente, plus la P - value est petite, plus l'expression différentielle de ce circrna est significative entre les deux groupes d'échantillons

⑥ significant up & down regulated circrna List: significativement différentiellement exprimé circrna liste contient fold change, P - value, et des informations détaillées annotées sur le circrna (les sites de liaison de l'ARNm linéaire et MIRNA correspondants).

Le client offre:

1, l'objet de l'expérience est l'échantillon de tissu, prenez la bonne quantité (50 - 100mg) d'échantillon de tissu frais ou d'échantillon de tissu correctement conservé, utilisez

Biopulverizer™ Frozen broyage des tissus, plus 1 m de réactif d'extraction d'ARN trizol (Invitrogen), l'ARN est extrait après utilisation de l'homogénat Mini Beater - 16.

2, les sujets expérimentaux sont des échantillons de cellules, chaque échantillon prend 1x106 ~ 1x107 cellules, plus 1m de l'ARN extrait réactif trizol (l'échantillon est des cellules collées, chaque boîte de pétri 10cm2 trizol utilisation est de 1 mL), après lyse extrait l'ARN.

Normes de livraison:

1, données de détection de puce

Code d'exploitation expérimental complet, rapport d'expérience (avec les résultats de l'analyse logicielle) et matériel expérimental

Service expérimental: