InmenaLancement de la sociétédeMiseq est un nouveau séquenceur qui intègre l'amplification, le séquençage et l'analyse de données sur un seul instrument, produisant plus de 1 go de données par opération et occupant seulement 2 pieds carrés. Le processus et la précision de miseq en font la plate - forme idéale pour des analyses génétiques rapides et économiques, adaptées à un large éventail d'applications. Pendant ce temps, illumina a été acheté en grande quantité par la FDA et est sur le point d'être certifié par la FDA, et en octobre 12, le flux de séquençage du système miseq a été mis à niveau vers 8G. La mise à niveau se fait de deux manières, une augmentation de la densité de Cluster, après la mise à niveau, la densité de Cluster augmente à 15 - 17 millions, et le nombre de lectures lues par Pair - end augmente à 30 - 34 millions; D'autre part, le flux est augmenté par la lecture séquentielle longue, qui atteint 2 * 300 pb, tandis que la vitesse de séquençage est également améliorée. À l'heure actuelle, Broad Research a atteint une longueur de lecture de 300 pb pour le séquençage à une extrémité avec des réactifs existants, et illumina est actuellement en séquençage interne pour compléter le séquençage Pair - end de 2 * 400 pb. Tout cela est garanti sur la base de résultats de données de haute qualité.

Paramètres de performance miseq

Illumina miseq temps de séquençage et volume de données

Illumina miseq comparaison des lectures

Processus de travail

Séquenceur illumina deuxième générationMiseq quatreGrandes caractéristiques

Période expérimentale plus courte: il faut 8 heures à partir de la préparation de l'échantillon pour obtenir des résultats de séquençage de haute qualité de plus de 100 M.

2, processus de préparation d'échantillon pratique: avec le modèle 50ngdna, 2 heures d'opération automatisée peuvent terminer le travail complet de préparation d'échantillon.

3, principe de séquençage: miseq poursuit les principes chimiques de séquençage par synthèse de bord des plates - formes Ga et hiseq.

Intégration complète: miseq peut effectuer indépendamment la génération de Clusters, le séquençage bidirectionnel et l'analyse des données, de sorte que le financement et l'espace de laboratoire ne soient plus un obstacle à la recherche NGS.

Séquenceur illumina deuxième générationGamme d'applications miseq

1, séquençage du Transcriptome

La plate - forme de séquençage miseq de paisenot est une plate - forme d'analyse transcriptomique pour les espèces dont le génome a été séquencé. L'équipe technique de la société a maintenant terminé le séquençage et l'analyse du Transcriptome d'une grande variété de plantes et d'animaux, y compris le poisson zèbre.

2, séquençage de la région V unique de l'ADNR 16S du métagénome

Le séquençage à haut débit d'une seule région V (V3 \ V4) de l'ADNR 16S a permis d'identifier la flore bactérienne et archéobactérienne. L'équipe technique de paisenot a utilisé illumina miseq pour séquencer la région V4 de l'ADNR 16S en combinaison avec roche 454 flx + pour séquencer les régions V1 ~ V3 de l'ADNR 16S pour identifier avec succès les bactéries de l'environnement intestinal des poulets.

Séquençage du Petit ARN

La longueur de lecture de 1 * 35 pb correspond à la longueur de séquençage du Petit ARN, qui est rapide et hautement sensible. L'équipe technique de paisenot a maintenant terminé le séquençage du Petit ARN pour les oies et le séquençage du Petit ARN pour une variété d'herbes chinoises.

4, re - séquençage: comprend le re - séquençage du génome entier, le séquençage simplifié du génome, le séquençage des Exons.

Illumina miseq est idéal pour le séquençage de génomes microbiens, un séquençage complet du génome microbien par exécution. Le 27 décembre 2011, l'équipe technique de paisenot a utilisé miseq pour effectuer simultanément le séquençage de bactéries lactiques (Lactobacillus casei Zhang et Lactobacillus casei P8) à des profondeurs de couverture génomique de 404 et 213 fois, respectivement, alignées à la séquence de référence, le génome atteignant une couverture complète, tout en détectant plusieurs variantes structurelles, y compris l'insertion, la délétion et les sites SNP, et en détectant la totalité du plasmide.

Présentation des données

* Les présentations de produits et les données ci - dessus proviennent d'illumina et ne sont fournies qu'à titre indicatif.Est soumis.