Expériences quantitatives non standard (Label - free)

Expériences quantitatives non standard (Label - free)

Quantification non standard (Label - free)

Quantification hors étalon (Label fiee): est une technique de protéomique différentielle non marquée qui ne nécessite pas l'utilisation de marqueurs isotopiques pour marquer les segments peptidiques, la quantification relative des segments peptidiques ou des protéines étant effectuée directement en fonction de la force du signal du pic du spectre de masse. Label - free analyse des segments peptidiques enzymatiques par couplage liquide fractionné HPLC. Il existe maintenant deux principales techniques de quantification non standard basées sur la spectrométrie de masse: la quantification des protéines basée sur des informations telles que la force du pic du segment peptidique associé à la spectrométrie de masse primaire, ainsi que la région du pic, et la quantification basée sur le nombre total de spectres de masse secondaires (spectral Counts) du segment peptidique correspondant à la protéine.

Étapes expérimentales

1. Traitement pré - protéique, y compris l'élimination des acides nucléiques, la quantification de la purification des protéines, l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide SDS;

2. Découpe enzymatique de glucose de protéine;

3. Purification polypeptidique; .

4. Analyse par spectrométrie de masse des mélanges de Polypeptides, y compris identification par spectrométrie de masse et comparaison des informations quantitatives;

5. Analyse de génération de lettres

Présentation des résultats

Cycles expérimentaux et normes de livraison

1. Cycle expérimental: 4 - 6 semaines

Normes de livraison: résultats de quantification des protéines, résultats d'identification, données brutes de spectrométrie de masse, résultats d'analyse généalogique (analyse G0). Analyse kegg, etc.)

Informations à confirmer

1. Genre de l'échantillon

2. Type d'échantillon (tissu ou cellules ou sang)

3. Nombre et regroupement des échantillons

4. Exigences analytiques

Références

[1] HuS, Qiu N, Liu Y, et al. Identification et étude protéomique comparative de la protéine de blanc d'oeuf de caille et de canard en utilisant l'électrophorèse en gel bidimensionnelle et la spectrométrie de masse tandem de temps de vol de désorption / ionisation laser assistée par matrice [J]. Volaille Science, 2016:pew033.

[2] Bouvet M, Turkieh A, Acosta-Martin A E, et al. Profilage protéomique des macrophages par électrophorèse 2D [J]. Journal

Expériences visualisées, 2014(93).

Service expérimental: