Séquenceur nanopore trois générations gridion

NégociableMise à jour sur05/07

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Vue d'ensemble

Le séquenceur nanopore de trois générations gridion est un système de bureau abordable et compact qui offre un séquençage à la demande et des capacités intégrées de traitement des données en temps réel. Capable d'exécuter cinq unités de streaming simultanément ou séparément avec un rendement total allant jusqu'à 150 GB, gridion MK1 offre un accès abordable aux avantages du séquençage de nanopores en temps réel à longue lecture pour les laboratoires et les fournisseurs de services occupés. Le traitement intégré des données haute performance atténue le besoin d'une infrastructure informatique complexe.

Détails du produit

I. Aperçu du produit

Oxford nanopore technologie ® deSéquenceur nanopore trois générations gridionMC Mk1Est un système de séquençage de table compact. Il permet de réaliser jusqu'à cinq expériences de séquençage simultanément ou séparément. Vous pouvez choisir d'utiliser cette partie des ressources en une seule fois. Gridion MK1 vous permet également d'offrir le séquençage des nanopores en tant que service.

Le gridion MK1 dispose de cinq ports de séquençage pour connecter des unités de streaming minion / gridion ou des adaptateurs flongle avec unités de streaming, tout en étant équipé d'un ordinateur intégré haute performance et d'un accélérateur Keynote. Le dispositif peut appeler les données générées par les cinq unités de flux / flongle en temps réel. Les produits chimiques et logiciels actuels permettent de générer jusqu'à 150 gbase de données pendant l'exécution de gridion MK1.

La mise en place de gridion MK1 nécessite très peu d'infrastructure et ne nécessite aucune mise à niveau. Le nouvel appareil nécessite simplement une alimentation et une connexion réseau via un port Ethernet.Les périphériques tels que le clavier et la souris fournissent trois interfaces USB 3.0. Le moniteur doit être connecté via isplayport. L'appareil est alimenté à partir du secteur via la ligne C13, via le bouton d'alimentation du panneau avant lorsqu'il est allumé.

纳米孔三代测序仪GridION

II. Technologies de base

Le séquençage nanopore d'Oxford est basé sur la technologie de détection monomoléculaire de nanopores. Lors du séquençage, les molécules d'acide nucléique (ADN / ARN) traversent les nanopores base par base sous forme de simple brin, sous l'action d'une motorase. Lorsque les bases passent, cela modifie l'intensité du courant à l'intérieur des nanopores et il existe des différences dans les signaux de courant correspondant aux différentes bases (A, T, C, g) et aux bases modifiées. L'appareil capte ces variations de courant en temps réel, via minknow ™ Des logiciels tels que se transforment en séquences de base, permettant le séquençage direct d'une seule molécule. Sans amplification PCR, cette technologie préserve les informations de modification de base et permet une analyse de données en temps réel, à la fois portable et efficace.

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Iii. Avantage de performance d'équipement

1. FlexibilitéPour:Séquenceur nanopore trois générations gridionMC Mk1Jusqu'à 5 cellules minion Flow indépendantes peuvent être exécutées simultanément, prenant en charge le séquençage parallèle de sous - échantillons ou la superposition multicanaux d'échantillons uniques, s'adaptant de manière flexible aux besoins de traitement Multi - échantillons ou augmentant la profondeur des données, améliorant considérablement l'efficacité des expériences.

2. Acquisition de données en temps réel: peut générer des données de séquençage instantanément, sans attendre la fin du processus de séquençage complet, ce qui permet d'obtenir rapidement des informations analytiques exploitables, en particulier pour les scénarios de vieillissement exigeants tels que la détection d'urgence.

3. Puissance de calcul intégrée: module de calcul intégré * pour une analyse directe des données en temps réel, sans avoir à dépendre d'une infrastructure informatique externe complexe, réduisant les seuils de déploiement des équipements et simplifiant les processus opérationnels expérimentaux.

4. Conception compacte et compacte: l'équipement occupe une petite zone, adopte une disposition de type Bureau, économise de l'espace de laboratoire, s'adapte à tous les types d'environnements de laboratoire, pas besoin de planifier une grande zone individuellement pour placer l'équipement.
5. Longueur de lecture illimitée: peut séquencer des molécules d'acide nucléique de longueur arbitraire de fragments courts à ultra - longs, sans limitation de longueur de fragment, peut résoudre efficacement les variations structurelles complexes du génome et d'autres problèmes difficiles, briser les limites du séquençage traditionnel à lecture courte et longue.

Iv. Applications applicables

1. Métagénomique bactérienne: 5 cellules Flow indépendantes peuvent traiter des échantillons en parallèle, en combinaison avec une lecture ultra - longue, une analyse précise de la structure de la flore et des gènes fonctionnels, 48 go / canal de données pour répondre à des études complexes sur la diversité de la flore.

2. Isolats bactériens: sortie de données élevée à canal unique garantit une couverture élevée du génome de l'isolat, un assemblage et une annotation rapides, une analyse des informations clés telles que les gènes de résistance, les facteurs de virulence et d'autres.

3. Génome entier bactérien: aucune amplification par PCR n'est nécessaire pour réduire les préférences de séquençage, la lecture ultra - longue résout efficacement les énigmes de séquence de répétition génomique et fournit des données de haute qualité pour la traçabilité évolutive bactérienne, le typage moléculaire.

4. Amplificateurs viraux: sortie de données en temps réel pour identifier rapidement les variations virales, plusieurs canaux en parallèle pour détecter simultanément plusieurs amplicons viraux, améliorer la surveillance des variations virales et l'efficacité des enquêtes épidémiologiques.

5. Pleine longueur 16S rRNA: couvre la séquence complète de l'arnr 16S pour éviter les problèmes d'ambiguïté de classification à lecture courte et longue, le multicanal prend en charge un grand nombre d'échantillons en parallèle, permettant une identification précise au niveau de la souche.

6. Sous - groupe complet: volume élevé de données pour répondre aux besoins de séquençage en profondeur de la région exonique, détection ultra - longue précision de longues lectures de variantes complexes telles que la délétion d'insertion, fournissant des données clés pour les maladies génétiques, la recherche liée aux tumeurs.

7. Transcriptome complet (adnc): pas besoin d'épissure pour obtenir des séquences d'adnc pleine longueur, distinguer clairement les sous - types de cisaillement variable, multicanaux en parallèle pour améliorer l'efficacité de détection des transcriptions à faible abondance.

8. Transcriptome plus petit (ARN direct): le séquençage direct de l'ARN conserve l'information sur la modification de base, la lecture ultra - longue pour obtenir la séquence transcrite complète, l'adaptation aux études de Transcriptome virales, biologiques inférieures et petites, l'analyse rapide de la dynamique transcriptionnelle.

V. réactifs et logiciels adaptés

Compatibilité Flow CellPrise en charge de toutes les cellules Flow de la série minion (telles que r9.4.1, r10.4), y compris les modèles spécifiques à l'ADN, à l'ARN et aux tests de modification;

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Ecologie logicielle: de série avec minknow ™ (acquisition de données), Guppy (reconnaissance des bases), minimap2 (alignement des séquences), peut être compatible avec des outils d'analyse tiers (tels que nanoplot, flye).

Zebrafish (Beijing) Technology Co., Ltd., vous fournir les paramètres de l'instrument, le prix, le type de sélection, le principe technique et d'autres informations, pour plus d'informations, bienvenue à nous contacter.

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