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Zebrafish (Beijing) Technology Co., Ltd
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Séquenceur nanopore trois générations promethion 24

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Vue d'ensemble

Le séquenceur de nanopore de trois générations promethion 24 fournit une solution de séquençage de bureau flexible et de grande capacité, idéale pour les grands projets et les laboratoires à haut débit. Parmi ceux - ci, promethion 24 prend en charge l'exécution de jusqu'à 24 unités de flux et le volume de sortie de données Max peut atteindre 14 t bases. Chaque unité de flux peut fonctionner indépendamment et peut fournir des services de séquençage longue lecture à la demande en fonction de divers besoins expérimentaux. Le module de calcul haute performance intégré à l'appareil permet l'identification des bases en temps réel et l'analyse ultérieure, ce qui permet d'obtenir rapidement des résultats de séquençage.

Détails du produit

I. Aperçu du produit

Séquenceur nanopore trois générations promethion 24Est un appareil à haut débit qui utilise la même technologie de base que les appareils minion, gridion, mais permet un traitement massivement parallélisé. La gamme d'appareils prend en charge jusqu'à 24 expériences de séquençage simultanées, chacune pouvant également être réalisée indépendamment. En outre, les utilisateurs peuvent fournir des services de séquençage de nanopores à l'aide de dispositifs promethion.
Séquenceur nanopore trois générations promethion 24Composé d'une unité de séquençage et d'une unité d'acquisition de données de série A: l'unité de séquençage est munie de 24 ports de séquençage pouvant être insérés par l'unité de flux promethion; L'unité d'acquisition de données est équipée d'un ordinateur intégré haute performance et d'un accélérateur de reconnaissance de base. Le dispositif permet la reconnaissance de base en temps réel des données générées par les 24 unités de flux. Avec le support actuel des réactifs chimiques et des logiciels, une seule unité de flux promethion peut produire jusqu'à 200 gbase de données.


II. Technologies de base


Le séquençage nanopore d'Oxford est basé sur la technologie de détection monomoléculaire de nanopores. Lors du séquençage, les molécules d'acide nucléique (ADN / ARN) traversent les nanopores base par base sous forme de simple brin, sous l'action d'une motorase. Lorsque les bases passent, cela modifie l'intensité du courant à l'intérieur des nanopores et il existe des différences dans les signaux de courant correspondant aux différentes bases (A, T, C, g) et aux bases modifiées. L'appareil capte ces variations de courant en temps réel, via minknow ™ Des logiciels tels que se transforment en séquences de base, permettant le séquençage direct d'une seule molécule. Sans amplification PCR, cette technologie préserve les informations de modification de base et permet une analyse de données en temps réel, à la fois portable et efficace.

纳米孔三代测序仪PromethION 24


Iii. Avantages de performance de base


Séquençage flexible à la demande sans attente de lots d'échantillons:Le temps de séquençage et le contenu peuvent être choisis de manière autonome en fonction de la demande, et l'unité de flux prend en charge le fonctionnement individuel ou collaboratif sans retarder l'expérience pour une taille d'échantillon compacte; La capacité de séquençage d'une unité de flux unique est environ 6 fois supérieure à celle d'une unité de flux minion et répond aux besoins en données à différentes échelles.

Multitâche à haut débit en parallèle, laboratoire de type service adapté:Prendre en charge plusieurs expériences d'ADN ou d'ARN simultanément, en combinaison avec la technologie de code à barres peut augmenter encore le volume de traitement des échantillons, répondre efficacement aux scénarios de séquençage à haut débit, et peut également fournir aux utilisateurs des services professionnels de séquençage de nanopores.

Seuil de déploiement bas, adapté aux différents types de laboratoires:L'équipement occupe une petite surface et peut être installé sans avoir à modifier les installations de laboratoire existantes; Équipé d'un support technique complet, il simplifie le processus de déploiement, qu'il s'agisse d'un petit laboratoire scientifique ou d'une grande institution de service.

Calcul tout - en - un haute performance, analyse efficace et pratique:Séquençage et analyse tout - en - un avec un processeur de nouvelle génération, 4 GPU nVIDIA série A, 60 to de stockage SSD et 512 go de Ram pour une puissance de calcul élevée; Préinstallé avec le système d'exploitation Ubuntu et le logiciel minknow, il démarre le séquençage et l'analyse en temps réel, réduisant considérablement le cycle d'acquisition des résultats.


Iv. Domaines d'application


Séquençage de grands génomes ou de projets: adaptation d'assemblages génomiques complexes tels que des humains, des plantes et des animaux de grande taille (riz, bovins, etc.) ou de grands projets de recherche scientifique cohérents en plusieurs étapes. Ses 24 unités de flux peuvent fonctionner de manière synchrone, unité de flux uniqueProduction de donnéesMax 200Gb, Capacité supérieure à minion environ6 foisIl peut rapidement couvrir les séquences répétées de grands génomes, les zones de variation structurelle, combinées à une analyse en temps réel à forte puissance de calcul pour raccourcir le cycle du projet.

Études de séquençage de la taille des populations: applicable dans des scénarios tels que l'analyse des associations de maladies humaines, le dépistage des populations de sélection animale et végétale. Prend en charge le séquençage parallèle Multi - échantillons, avec la technologie de code à barres pour traiter efficacement des centaines d'échantillons de population, 512 go de Ram et 4 GPU nVIDIA série A garantissent un alignement rapide des données à grande échelle et la détection des variations, fournissant une solution à haut débit pour la recherche en génétique des populations.

High multiplex petit génome ou région ciblée séquençage: détection par lots de petits génomes pour les bactéries, les champignons, etc., ou analyse de zones ciblées pour les gènes humains responsables du cancer, les cibles de médicaments, etc. Les 24 unités de flux peuvent être divisées pour traiter différents groupes d'échantillons, une seule unité de haute capacité pour répondre aux besoins de couverture en profondeur de la zone ciblée, sans attente de lot d'échantillons, adaptée aux tâches de séquençage de faible volume à haute fréquence telles que la détection clinique, la construction de banques de ressources microbiennes et autres.

Études transcriptomiques complètes (ARN direct ou adnc): analyse de cisaillement variable, suivi dynamique de la transcription microbienne pour soutenir le Transcriptome complet des plantes et des animaux. Le séquençage direct de l'ARN peut conserver l'information sur les modifications de base, le séquençage de l'adnc couvrant les transcriptions de faible abondance; La puissance de calcul tout - en - un de l'appareil peut analyser des séquences transcrites complètes en temps réel, éviter les erreurs d'épissage courtes et longues, faciliter la régulation de l'expression génique, le criblage des transcriptions liées à la maladie et d'autres études.


V. spécifications de l'équipement


Dimensions et poids Unité de séquençage promethion 24:
Hauteur 190 X largeur 590 x profondeur 430 mm, 23 kg
Spécifications de l'unité d'acquisition de données 60 to de stockage SSD, 512 go de RAM, 4 cartes GPU nVIDIA Ampere pour l'accélération des appels de base
Logiciel préinstallé Linux (UBUNTU) comme système, promethion comme système(intérieur minknow),Logiciel Dorado
Conditions environnementales Conçu pour être séquencé à température ambiante (+ 18°C à + 22°c),
L'utilisateur doit réserver un espace de 30 cm à l'arrière et sur les côtés de l'appareil.
Remarque :L'arrière de l'instrument chauffe pendant le fonctionnement.





Zebrafish (Beijing) Technology Co., Ltd., vous fournir les paramètres de l'instrument, le prix, le type de sélection, le principe technique et d'autres informations, pour plus d'informations, bienvenue à nous contacter.