Comment la spectrométrie de masse peut être utilisée pour l'analyse des protéines - petapock Biotech

Comment la spectrométrie de masse peut être utilisée pour l'analyse des protéines - petapock BiotechDetection Technology Service détails Introduction

La technique de spectrométrie de masse est une méthode de séparation et de détection basée sur le rapport masse - charge (M / z) des molécules ionisées, largement utilisée dans les analyses de dànbáizhì. Le spectrogramme de masse de l'échantillon est obtenu en ionisant les molécules de l'échantillon et en les faisant accélérer, dévier dans un champ électrique ou magnétique, en réalisant une séparation en fonction de la différence de masse et de charge des ions, qui à son tour enregistre la force et le rapport masse - charge des ions au moyen d'un détecteur. Cette technique permet à l'analyse dànbáizhì d'être plus efficace et jīngquè, capable d'étudier en profondeur la structure, la fonction et les interactions du dànbáizhì.

I. Étapes clés de la spectrométrie de masse pour l'analyse de dànbáizhì

Préparation de l'échantillon: l'échantillon dànbáizhì peut être un simple dànbáizhì (par exemple, une solution purifiée de dànbáizhì avec une pureté > 90%) ou un mélange complexe (par exemple, un lysat cellulaire, un extrait tissulaire). La séparation et la purification du dànbáizhì sont souvent effectuées au cours de la préparation par électrophorèse sur gel SDS - page, chromatographie d'affinité, filtration sur gel, etc., assurant une analyse ultérieure du dànbáizhì plus jīngzhìn.

2. Protéase: la protéase est une étape importante dans l'analyse de dànbáizhì. L'analyse directe est difficile en raison de la grande masse moléculaire du dànbáizhì complet et nécessite généralement la lyse de l'enzyme dànbáizhì en segments peptidiques plus petits avant l'analyse par spectrométrie de masse. Les enzymes couramment utilisées comprennent yídànbáiméi (Trypsin), qui est capable de couper à la lysine (Lysine) et jīngānsuān (arginine) de dànbáizhì, produisant un segment polypeptidique composé de 6 à 40 résidus d'acides aminés.

3. Analyse par spectrométrie de masse: le segment peptidique après enzymolyse est analysé par spectrométrie de masse. Un spectromètre de masse se compose généralement de trois parties: une source d'ions, un analyseur de masse et un détecteur. La source d'ions est responsable de l'ionisation du segment peptidique et les méthodes couramment utilisées sont l'ionisation par électrospray (ESI) et la désorption / ionisation laser assistée par matrice (MALDI). Les Analyseurs de masse sont séparés en fonction du rapport masse - charge des ions, les plus utilisés étant Ion Trap, tof, QUADRUPOLE et orbitrap. Le détecteur enregistre la force et le rapport masse - charge des ions, générant un spectrogramme de masse qui fournit des données pour les analyses ultérieures de dànbáizhì.

Extraction de la base de données et caractérisation de dànbáizhì: les données obtenues par spectrométrie de masse doivent être comparées à la base de données de dànbáizhì, une étape qui utilise généralement un logiciel spécialisé pour évaluer la fiabilité des résultats d'identification sous forme fractionnée en faisant correspondre algorithmiquement le spectrogramme de masse réel au spectrogramme de masse théorique (c. - à - d. Le spectrogramme de masse du segment peptidique prédit après la lyse enzymatique de dànbáizhì).

II. Application de la spectrométrie de masse à l'analyse de dànbáizhì

Détermination de la séquence de dànbáizhì: par spectrométrie de masse, il est possible de déterminer la séquence d'acides aminés de dànbáizhì. Il s'agit généralement, après lyse de l'enzyme dànbáizhì, de détecter le poids moléculaire de chaque segment peptidique par spectrométrie de masse, en combinaison avec une recherche dans une base de données, pour déduire la séquence de dànbáizhì.

Analyse des modifications post - traductionnelles du dànbáizhì: les techniques de spectrométrie de masse permettent de détecter les modifications post - traductionnelles du dànbáizhì telles que la phosphorylation, l'acétylation, l'Ubiquitination, etc. En analysant le profil de masse du segment peptidique à proximité du site modifié, il est possible de déterminer le type et le site de la modification, révélant l'effet de la modification sur la fonction dànbáizhì.

Analyse quantitative de dànbáizhì: les techniques de spectrométrie de masse peuvent également être utilisées pour l'analyse quantitative de dànbáizhì. La force du signal de spectrométrie de masse du dànbáizhì ou d'un segment peptidique particulier est mesurée par des méthodes de marquage isotopique (par exemple itraq, TMT) ou sans quantité de biāojìdìng (par exemple label Free Quantitation, lfq), ce qui permet de déterminer l'abondance relative ou juédì du dànbáizhì. Cela permet à l'analyse dànbáizhì de mener une étude approfondie des variations d'expression de dànbáizhì dans différentes conditions.

Études d'interaction dànbáizhì: les techniques de spectrométrie de masse combinées à des expériences d'interaction dànbáizhì (p. ex., immunocoprécipitation IP) permettent d'identifier et d'analyser les réseaux d'interaction entre dànbáizhì. Cela aide à révéler les mécanismes fonctionnels et régulateurs du dànbáizhì dans les voies de signalisation cellulaire.

La technologie de spectrométrie de masse continuera d'élargir son champ d'application dans les sciences de la vie et la biomédecine, en particulier dans l'analyse de dànbáizhì, en fournissant des moyens d'analyse plus jīngzhān et efficaces qui fournissent un soutien solide pour révéler les mystères de dànbáizhì et résoudre des problèmes scientifiques majeurs.

Projets en vedette de Biotech de baitepike

I. séquençage des protéines

Utilisant le nouveau spectromètre de masse obitrap fusion Lumos de thermo Corporation et le système de séquençage de dégradation Edman de Shimadzu Corporation pour l'analyse des séquences de dànbáizhì, battlepike Biotechnology offre des services d'analyse de séquençage de protéines basés sur la spectrométrie de masse, y compris l'analyse de la composition en acides aminés de dànbáizhì, nduāncèxù, cduāncèxù et l'analyse de séquences complètes, ainsi que des services d'analyse de séquences n - terminales de dànbáizhì basés sur la dégradation d'Edman. Pour dànbáizhì de séquences théoriques inconnues, un service de séquençage de Novo dànbáizhì basé sur la méthode de séquençage de novo est fourni pour effectuer l'analyse de la séquence protéique.

※ avantage de service:

1. Avec obitrap fusion Lumos, un instrument de spectrométrie de masse avancé dans le monde;

2. Une couverture de 100% de la séquence protéique cible déterminée peut être obtenue;

3. Peut déterminer jusqu'à 70 séquences d'acides aminés à l'extrémité n de la protéine;

4. Plusieurs formes d'échantillons peuvent être déterminées: solution de protéine, bande de protéine de PVDF;

5. Faible quantité d'échantillon: l'échantillon de protéine a besoin de seulement 5 - 10ug pour compléter l'essai;

Le séquençage n'est pas affecté par les modifications n - terminales telles que la fermeture n - terminale, la Pec et la glycosylation.

II. Dànbáizhì omique

Utilisant la plate - forme de spectrométrie de masse orbitrap fusion Lumos de thermo Fisher en combinaison avec Nano - LC, petitpeck Biotechnology fournit de nombreux services d'analyse dànbáizhìomique tels que la dànbáizhìomique quantitative, la dànbáizhìomique ciblée, la polypeptidomique, la protéomique modifiée post - traductionnelle et bien plus encore. En outre, petitpack Biotech a lancé un nouveau service de 4ddànbáizhì basé sur timstof pro, qui facilite les travaux de recherche tels que la protéomique à micro - échantillons, la médecine à grands échantillons et la modification à haut débit.

※ avantage de service:

1. Analyse quantitative des protéines à haut débit: analyse expérimentale à grande échelle par groupe multicontrôle, découverte de nouveaux biomarqueurs;

2. In Vivo In vitro de nombreuses méthodes de marquage dànbáizhì, adaptées à l'analyse de nombreux échantillons de tissus, de cellules, de sang, etc.;

3. Haute sensibilité d'analyse de spectrométrie de masse, haute répétition des résultats expérimentaux;

4. Protéines de faible abondance détectables, large gamme linéaire;

5. Zhuānyè analyse Bioinformatique, l'analyse est plus systématique et précise.

Iii. Analyse technique en flux par spectrométrie de masse unicellulaire

La biotechnologie de battlepike utilise le système de flux de spectrométrie de masse de fluidigm pour l'analyse de la technologie de flux de spectrométrie de masse unicellulaire, utilisant des marqueurs d'éléments métalliques (généralement des anticorps spécifiques marqués par des éléments métalliques) pour marquer les molécules à la surface et à l'intérieur des cellules, puis isolant les cellules individuelles avec le principe de cellules de flux, puis analysant le spectre de masse atomique des cellules individuelles par spectrométrie de masse à plasma inductif (ICP - MS), zuì après avoir converti les données du spectre de masse atomique en poids d'expression moléculaire signal à la surface et à l'intérieur des cellules.

※ avantage de service:

1. Technologie avancée pour combler les lacunes technologiques

L'utilisation de la technologie d'anticorps de marquage métallique évite le problème des canaux fluorescents en flux traditionnels qui sont peu nombreux et susceptibles d'interagir les uns avec les autres. Avec la caractérisation simultanée de plusieurs indicateurs au niveau unicellulaire, la biotechnologie de petapock peut détecter simultanément 51 protéines cibles.

2. Grand nombre d'analyses, coût inférieur

Rnaseq unicellulaire est limitée par le coût et d'autres facteurs, le nombre d'analyses de toutes les cellules de l'échantillon est généralement d'environ 2 x 10 ^ 4, tandis que la spectrométrie de masse en flux une fois (échantillon unique) peut analyser au moins 10 ^ 5 cellules, ce qui permet d'obtenir des améliorations de L'ordre de grandeur, et le coût n'est pas plus élevé que le rnaseq unicellulaire.

3. Grandes perspectives d'application

① les résultats de la spectrométrie de masse en flux peuvent donner des changements dans les sous - populations cellulaires, avec de grandes perspectives de recherche dans le diagnostic clinique, l'étude des mécanismes de la maladie, etc.;

② combiner la technologie d'étiquette métallique avec d'autres technologies aura une nouvelle direction d'application. En plus des protéines conventionnelles, la technologie cellulaire en flux par spectrométrie de masse peut également être utilisée pour la modification post - traductionnelle des protéines;

③ peut détecter la survie cellulaire, la taille des cellules, la quantité d'expression des transcripteurs d'ARNm, le taux de synthèse de l'ADN, ainsi que l'activité de la protéase, etc.

Analyse immunopolypeptidomique basée sur la spectrométrie de masse de haute précision et découverte de nouveaux antigènes

La solution unique d'analyse immunopolypeptidomique et de découverte de nouveaux antigènes basée sur la spectrométrie de masse de haute précision de battlepike Biotechnology comprend notre programme exclusif d'enrichissement et d'identification d'immunopeptides hautement sensibles. Nous sommes en mesure de vous aider à identifier et identifier plus de 10 000 Polypeptides de type I et plus de 10 000 Polypeptides de type II. L'analyse immunopeptidomique via notre plate - forme d'analyse immunopolypeptidomique optimisée à haut débit permet une identification et une quantification reproductibles à partir de matériaux d'échantillon de petite taille. Le service peut être appliqué à la recherche à grande échelle et vise à aider les chercheurs à trouver des solutions au cancer, aux maladies immunitaires et aux maladies infectieuses, en explorant des cibles inconnues.

V. caractérisation des médicaments biologiques

Batepeck est basé sur la technologie de spectrométrie de masse à haute résolution, MALDI TOF， Technologie de séparation chromatographique à haute efficacité, offrant une gamme de protocoles d'analyse biopharmaceutique pour wánshàn, allant de la composition en acides aminés et de l'analyse structurale primaire de produits biologiques tels que dànbáizhì, POLYPEPTIDES, anticorps, vaccins, à l'analyse de la variabilité et de la pureté du produit. Vise à fournir des services d'analyse biopharmaceutique de haute qualité pour aider les fabricants de médicaments biologiques à améliorer la qualité des médicaments biologiques.

Les sept plates - formes d'inspection de la biotechnologie de battlepike

Petitpeck Biotechnology - caractérisation de produits biologiques, Service de qualité multiomique en spectrométrie de masse biologique

Beijing BaiTai Pike Biotech Co., Ltd. S'engage à fournir des services zhuānyè tels que l'inspection de contrôle de qualité et la vérification de projet pour les industries biologiques / pharmaceutiques et des dispositifs médicaux. Le laboratoire de la société suit les règlements et les directives de la nmpa, de l'ich, de la FDA et de l'EMA, etc., avec la double certification du système de qualité CNAS / ISO9001, un système de qualité complet a été établi, les données sont sauvegardées à chaud et à froid / hors site, les équipements sont régulièrement mesurés / vérifiés pendant la période, le suivi de l'audit logiciel, la solution tout - en - un et les services techniques sont fournis aux clients pour soutenir la recherche et le développement de nouveaux médicaments, l'enregistrement des déclarations de médicaments et la libération de la production.

1. La société adopte le système de contrôle de qualité ISO9001, zhuānyè fournit des services d'analyse de détection cro basés sur la spectrométrie de masse;

2. Reconnu par le laboratoire national CNAS pour fournir aux clients des services de recherche de qualité pharmaceutique conformes à la réglementation pharmaceutique mondiale;

3. Le domaine d'activité couvre dànbáizhì omics, polypeptidomics, Metabolomics, caractérisation biopharmaceutique, analyse unicellulaire, flux de spectrométrie de masse unicellulaire, analyse de nuage de Genesis et analyse intégrée de spectrométrie de masse biologique multiomics, etc.;

4. Sept plates - formes d'inspection de contrôle de qualité pour répondre à vos besoins de service à guichet unique;

5. Service 3000 + entreprises, 10000 + choix du client;

6. Dédié à vous fournir un excellent service d'analyse de spectrométrie de masse biologique!

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