Séquençage de novo de Polypeptides - petapock Biotech

Séquençage de novo de Polypeptides - petapock BiotechDetection Technology Service détails Introduction

La technique du séquençage de novo Peptide (de novo Peptide sequencing) joue un rôle essentiel dans le domaine de la recherche en domotique. Cette technique a permis aux chercheurs d'effectuer une analyse directe de la séquence d'acides aminés d'un polypeptide ou dànbáizhì en l'absence de séquence de référence. La naissance et le développement du séquençage de novo des Polypeptides ont considérablement amélioré notre compréhension de la diversité et de la complexité du dànbáizhì, révélant notamment les avantages de son dàtè dans l'analyse du dànbáizhì inconnu, du dànbáizhì Mutant ou du dànbáizhì non modal.

1. Principes de base

Les techniques de séquençage de novo des Polypeptides reposent principalement sur la combinaison de techniques de spectrométrie de masse avec des algorithmes de calcul. Le cœur de cette technique réside dans l'analyse qualitative de haute précision des segments peptidiques à l'aide de techniques de spectrométrie de masse produisant des ions fragments de rupture de segments peptidiques caractéristiques par des moyens techniques tels que la dissociation par collision à haute énergie (HCD), la dissociation induite par collision (CID), la dissociation par transfert d'électrons (ETD). Le rapport masse / charge (valeur M / z) de ces ions fragments porte l'information structurale des résidus d'acides aminés du segment peptidique. Ces données de spectrométrie de masse sont ensuite analysées par un algorithme de calcul visant à reconstruire la séquence d'acides aminés du segment peptidique. Actuellement, les méthodes de calcul couramment utilisées comprennent des algorithmes de correspondance spectrale, des algorithmes de modèles probabilistes, ainsi que des algorithmes de réseaux neuronaux, entre autres.

2. Processus technique

Le procédé technique de séquençage de novo de Polypeptides comprend principalement les étapes suivantes:

Préparation de l'échantillon: l'échantillon de polypeptide est purifié, déminéralisé et d'autres traitements pour assurer la libération de wánquán et la purification du segment peptidique afin de réduire les interférences de fond et d'améliorer la sensibilité de l'analyse de spectrométrie de masse.

2. Analyse par spectrométrie de masse: le mélange de segments peptidiques est introduit dans un spectromètre de masse pour une analyse par spectrométrie de masse à haute résolution. Actuellement, les instruments de spectrométrie de masse couramment utilisés comprennent principalement la spectrométrie de masse quadrupolaire à temps de vol (Q - TOF), la spectrométrie de masse à puits d'ions linéaires (ltq) et la spectrométrie de masse à puits d'ions orbitals (orbitrap). Le spectromètre de masse produira un grand nombre de profils de masse contenant chacun des pics de valeurs M / z différentes qui représentent les ions fragmentés du segment peptidique.

Analyse des données: avec l'outil logiciel zhuānyè, les données de spectrométrie de masse sont analysées en profondeur en vue de reconstruire la séquence d'acides aminés du segment peptidique. Le processus nécessite une combinaison de facteurs, y compris la Force des ions fragmentés, le degré jīngquè de la valeur M / Z et les propriétés physico - chimiques des acides aminés.

3. Domaines d'application

La technologie de séquençage de novo des Polypeptides montre son vaste potentiel d'application dans de nombreux domaines:

Dans le domaine de la recherche en polypeptidomie, la technologie peut aider les chercheurs à identifier de nouveaux Polypeptides en l'absence de séquences de référence, ce qui permet d'élargir la base de données omiques.

En ce qui concerne la découverte de marqueurs de maladies, les techniques de séquençage de novo peuvent révéler de nouveaux marqueurs polypeptidiques associés à des maladies spécifiques, fournissant des indices clés pour le diagnostic précoce et le traitement de la maladie.

3. Dans le domaine de la recherche microbiologique, pour les micro - organismes dans des organismes non modaux ou des échantillons environnementaux, les techniques de séquençage ab initio permettent de révéler la composition polypeptidique de leur dútè, contribuant à une compréhension approfondie des fonctions écologiques et des relations évolutives des micro - organismes.

4. Dans le processus de développement de médicaments, les techniques de séquençage ab initio peuvent être utilisées pour identifier les protéines cibles de l'action des médicaments, optimiser la conception des médicaments et les stratégies de dépistage.

La technologie de séquençage de novo des Polypeptides, en tant qu'outil clé de la recherche en dànbáizhì omique, a démontré son potentiel d'application remarquable dans de nombreux domaines.

Projets en vedette de Biotech de baitepike

I. séquençage des protéines

Utilisant le nouveau spectromètre de masse obitrap fusion Lumos de thermo Corporation et le système de séquençage de dégradation Edman de Shimadzu Corporation pour l'analyse des séquences de dànbáizhì, battlepike Biotechnology offre des services d'analyse de séquençage de protéines basés sur la spectrométrie de masse, y compris l'analyse de la composition en acides aminés de dànbáizhì, nduāncèxù, cduāncèxù et l'analyse de séquences complètes, ainsi que des services d'analyse de séquences n - terminales de dànbáizhì basés sur la dégradation d'Edman. Pour dànbáizhì de séquences théoriques inconnues, un service de séquençage de Novo dànbáizhì basé sur la méthode de séquençage de novo est fourni pour effectuer l'analyse de la séquence protéique.

※ avantage de service:

1. Avec obitrap fusion Lumos, un instrument de spectrométrie de masse avancé dans le monde;

2. Une couverture de 100% de la séquence protéique cible déterminée peut être obtenue;

3. Peut déterminer jusqu'à 70 séquences d'acides aminés à l'extrémité n de la protéine;

4. Plusieurs formes d'échantillons peuvent être déterminées: solution de protéine, bande de protéine de PVDF;

5. Faible quantité d'échantillon: l'échantillon de protéine a besoin de seulement 5 - 10ug pour compléter l'essai;

Le séquençage n'est pas affecté par les modifications n - terminales telles que la fermeture n - terminale, la Pec et la glycosylation.

II. Dànbáizhì omique

Utilisant la plate - forme de spectrométrie de masse orbitrap fusion Lumos de thermo Fisher en combinaison avec Nano - LC, petitpeck Biotechnology fournit de nombreux services d'analyse dànbáizhìomique tels que la dànbáizhìomique quantitative, la dànbáizhìomique ciblée, la polypeptidomique, la protéomique modifiée post - traductionnelle et bien plus encore. En outre, petitpack Biotech a lancé un nouveau service de 4ddànbáizhì basé sur timstof pro, qui facilite les travaux de recherche tels que la protéomique à micro - échantillons, la médecine à grands échantillons et la modification à haut débit.

※ avantage de service:

1. Analyse quantitative des protéines à haut débit: analyse expérimentale à grande échelle par groupe multicontrôle, découverte de nouveaux biomarqueurs;

2. In Vivo In vitro de nombreuses méthodes de marquage dànbáizhì, adaptées à l'analyse de nombreux échantillons de tissus, de cellules, de sang, etc.;

3. Haute sensibilité d'analyse de spectrométrie de masse, haute répétition des résultats expérimentaux;

4. Protéines de faible abondance détectables, large gamme linéaire;

5. Zhuānyè analyse Bioinformatique, l'analyse est plus systématique et précise.

Iii. Analyse technique en flux par spectrométrie de masse unicellulaire

La biotechnologie de battlepike utilise le système de flux de spectrométrie de masse de fluidigm pour l'analyse de la technologie de flux de spectrométrie de masse unicellulaire, utilisant des marqueurs d'éléments métalliques (généralement des anticorps spécifiques marqués par des éléments métalliques) pour marquer les molécules à la surface et à l'intérieur des cellules, puis isolant les cellules individuelles avec le principe de cellules de flux, puis analysant le spectre de masse atomique des cellules individuelles par spectrométrie de masse à plasma inductif (ICP - MS), zuì après avoir converti les données du spectre de masse atomique en poids d'expression moléculaire signal à la surface et à l'intérieur des cellules.

※ avantage de service:

1. Technologie avancée pour combler les lacunes technologiques

L'utilisation de la technologie d'anticorps de marquage métallique évite le problème des canaux fluorescents en flux traditionnels qui sont peu nombreux et susceptibles d'interagir les uns avec les autres. Avec la caractérisation simultanée de plusieurs indicateurs au niveau unicellulaire, la biotechnologie de petapock peut détecter simultanément 51 protéines cibles.

2. Grand nombre d'analyses, coût inférieur

Rnaseq unicellulaire est limitée par le coût et d'autres facteurs, le nombre d'analyses de toutes les cellules de l'échantillon est généralement d'environ 2 x 10 ^ 4, tandis que la spectrométrie de masse en flux une fois (échantillon unique) peut analyser au moins 10 ^ 5 cellules, ce qui permet d'obtenir des améliorations de L'ordre de grandeur, et le coût n'est pas plus élevé que le rnaseq unicellulaire.

3. Grandes perspectives d'application

① les résultats de la spectrométrie de masse en flux peuvent donner des changements dans les sous - populations cellulaires, avec de grandes perspectives de recherche dans le diagnostic clinique, l'étude des mécanismes de la maladie, etc.;

② combiner la technologie d'étiquette métallique avec d'autres technologies aura une nouvelle direction d'application. En plus des protéines conventionnelles, la technologie cellulaire en flux par spectrométrie de masse peut également être utilisée pour la modification post - traductionnelle des protéines;

③ peut détecter la survie cellulaire, la taille des cellules, la quantité d'expression des transcripteurs d'ARNm, le taux de synthèse de l'ADN, ainsi que l'activité de la protéase, etc.

Analyse immunopolypeptidomique basée sur la spectrométrie de masse de haute précision et découverte de nouveaux antigènes

La solution unique d'analyse immunopolypeptidomique et de découverte de nouveaux antigènes basée sur la spectrométrie de masse de haute précision de battlepike Biotechnology comprend notre programme exclusif d'enrichissement et d'identification d'immunopeptides hautement sensibles. Nous sommes en mesure de vous aider à identifier et identifier plus de 10 000 Polypeptides de type I et plus de 10 000 Polypeptides de type II. L'analyse immunopeptidomique via notre plate - forme d'analyse immunopolypeptidomique optimisée à haut débit permet une identification et une quantification reproductibles à partir de matériaux d'échantillon de petite taille. Le service peut être appliqué à la recherche à grande échelle et vise à aider les chercheurs à trouver des solutions au cancer, aux maladies immunitaires et aux maladies infectieuses, en explorant des cibles inconnues.

V. caractérisation des médicaments biologiques

Batepeck est basé sur la technologie de spectrométrie de masse à haute résolution, MALDI TOF， Technologie de séparation chromatographique à haute efficacité, offrant une gamme de protocoles d'analyse biopharmaceutique pour wánshàn, allant de la composition en acides aminés et de l'analyse structurale primaire de produits biologiques tels que dànbáizhì, POLYPEPTIDES, anticorps, vaccins, à l'analyse de la variabilité et de la pureté du produit. Vise à fournir des services d'analyse biopharmaceutique de haute qualité pour aider les fabricants de médicaments biologiques à améliorer la qualité des médicaments biologiques.

Les sept plates - formes d'inspection de la biotechnologie de battlepike

Petitpeck Biotechnology - caractérisation de produits biologiques, Service de qualité multiomique en spectrométrie de masse biologique

Beijing BaiTai Pike Biotech Co., Ltd. S'engage à fournir des services zhuānyè tels que l'inspection de contrôle de qualité et la vérification de projet pour les industries biologiques / pharmaceutiques et des dispositifs médicaux. Le laboratoire de la société suit les règlements et les directives de la nmpa, de l'ich, de la FDA et de l'EMA, etc., avec la double certification du système de qualité CNAS / ISO9001, un système de qualité complet a été établi, les données sont sauvegardées à chaud et à froid / hors site, les équipements sont régulièrement mesurés / vérifiés pendant la période, le suivi de l'audit logiciel, la solution tout - en - un et les services techniques sont fournis aux clients pour soutenir la recherche et le développement de nouveaux médicaments, l'enregistrement des déclarations de médicaments et la libération de la production.

1. La société adopte le système de contrôle de qualité ISO9001, zhuānyè fournit des services d'analyse de détection cro basés sur la spectrométrie de masse;

2. Reconnu par le laboratoire national CNAS pour fournir aux clients des services de recherche de qualité pharmaceutique conformes à la réglementation pharmaceutique mondiale;

3. Le domaine d'activité couvre dànbáizhì omics, polypeptidomics, Metabolomics, caractérisation biopharmaceutique, analyse unicellulaire, flux de spectrométrie de masse unicellulaire, analyse de nuage de Genesis et analyse intégrée de spectrométrie de masse biologique multiomics, etc.;

4. Sept plates - formes d'inspection de contrôle de qualité pour répondre à vos besoins de service à guichet unique;

5. Service 3000 + entreprises, 10000 + choix du client;

6. Dédié à vous fournir un excellent service d'analyse de spectrométrie de masse biologique!

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